顺应潮流：仅尿液ctDNA-MRD检测的应用前景！

"吡啶化被归属于MRD测定的潜质是完全一致的，愿意这些进展将之前降低更进一步MRD测定的效能。"

白血病的MRD测定是一种精准且特异的用于检测白血病较低血压毒素之中面源性遗传物质（如ctDNA）比起数量的分析方法。在这种静止状态下，较低血压没肉眼可见的软组织，但确实共存基准病理底片分析方法能够测定到但之后才会导致白血病罹患的也就是说软组织。

MRD，常专指也就是说存留软组织（Minimal Residual Disease）。转用“Minimal” （也就是说）这个词，是因为它在文献资料和病理研究者之中面不够常用。不过，“Minimal”这个词有可能带有“误导”，因为低水准的发炎在病状和病症决策各个方面也有可能带有极为重要意义。“Measurable”（可测量）一词可不够吻合地描述存留在病症毒素的肿瘤细胞的共存。NCCN概要同时转用了“Minimal Residual Disease”（也就是说存留软组织）和“Measurable Residual Disease”（可测量存留软组织）两个术语。

此外，可行性科学家表明在分子水准上测定多种白血病类型的ctDNA某种相对带有病理功用，文献资料和病理研究者有时也才会转用“Molecular Residual Disease”（分子存留软组织）一词。

近期，国内在实体之中面基于ctDNA的MRD分析（ctDNA-MRD）的病理信息和论据越发多，启动时了实体疣MRD测定的波澜。实体疣ctDNA-MRD测定的技术开发流派主要有两大类：

1）Tumor-informed assays（知情量化）

对原发其组织顺利进行核酸以鉴定较低血压的特异真核生物变异图集，然后设计者聚合酶独创panel或转用互换panel顺利进行独创的ctDNA测定量化。

2）Tumor-uninformed assays（知悉量化）

也可以专指Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即无无需原发其组织，大部分依赖于一组预先选定聚合酶/探针设计者的与白血病类型之外的互换panel顺利进行ctDNA测定量化，常在测定ctDNA等位基因型的同时，；还有ctDNA吡啶化或短片组学等的大学分析方法。弥补了其组织在手果显示偏低或检测亚基偏低或TAT过长等原因。

Tumor-informed assays的技术开发手段不够符合普罗大众的认知，在保证较低选择性的某种相对下，可通过检测多亚基的sample-level（在手果显示水准）进一步降低其频叛将，技术开发比叛将比较比较简单不是比如说较低。Tumor-uninformed assays的技术开发手段不够值得注意早筛，通过降低site-level（亚基水准）测定频叛将并；还有ctDNA吡啶化或短片组学并在手合机器学习算法进一步降低其频叛将和选择性，技术开发比叛将比较比较简单较较低。

2021年4同月29日，《Clinical Cancer Research》Skype发表文章了“大部分转用肝脏ctDNA测定在手乳腺癌较低血压也就是说存留软组织（MRD）”的发表文章文章，首次公开了Guardant Reveal的科学家信息：MRD测定频叛将约达到91%，选择性约达100%，这些见到支持了大部分肝脏ctDNA-MRD测定（Tumor-uninformed assays）的潜在病理应用于。

2021年8同月13日，《Clinical Cancer Research》Skype发表文章了“顺应潮流：大部分肝脏ctDNA-MRD测定的应用于前景”的发表文章文章，在这之中科学家者们讨论分析了大部分肝脏ctDNA测定MRD的能力，以及将吡啶化为基础到ctDNA测定的潜在好处。2

Parikh及其朋友1 和Taieb及其朋友3 讨论了大部分肝脏ctDNA-MRD测定在在手乳腺癌（CRC）较低血压之中面的潜在病理应用于。

▲ ctDNA吡啶化和等位基因型在两项科学家之中面的应用于比较（Parikh和Taieb）

在手乳腺癌（CRC）的病症始终面临着一个考验，即众多的CRC较低血压因晚期疾病罹患而过早死亡。尽管病理转用了基准的专用病症，但较低不确定性IIIC期CRC较低血压的5年死亡叛将也大部分有53%，正因如此是没见到底片学上未能测定到的也就是说存留软组织（MRD）。4

以外，仍当务之急吻合具体哪些较低血压术后共存MRD，以努力聘请减少或增加专用病症，并增加救活的某种相对，同时以求地减少不必要病症的之外危险性。

在过去的几年之中，我们对ctDNA在CRC诊断和病状之中面的应用于有了广泛的了解到。以外，基于ctDNA的MRD分析正广泛用到白血病的病症之中面。

ctDNA是由DNA的短短片组成（大约130-150bp），由肿瘤细胞通过凋亡、坏死或表皮无罪释放到循环系统之中面。 ctDNA的半衰期不够长致使其带入敏感的实时超载；也，它的共存有可能反映了底片学上看不见的微转移。

在救活性病症在手束后，ctDNA之中面单单现的体细胞等位基因型对随后的底片学罹患带有较较低的乙型肝炎预测价值，比如说是当这些等位基因型与开刀的其组织之中面的等位基因型相匹配时。测定这种ctDNA判别的MRD可以在I-III期CRC之中面提前底片学数同月预测罹患，从而为一组之后才会罹患的CRC较低血压获取一个分析新疗法的窗口。然而，这些ctDNA基础等位基因型判别的MRD测定分析方法的频叛将始终是有限的，当务之急改进其测定效能。

ctDNA的吡啶化测定要强ctDNA的基础等位基因型测定。ctDNA的吡啶化间歇性在CRC之中面极为常见，并被视为大多数癌变的晚期先决条件。这种吡啶化，具体判别为DNA之中面双链的C5所在位置添加吡啶基团，调节邻近等位基因的表约达，以外经典的抑癌等位基因失活。与基础等位基因型比起，CRC之中面共存不够多的吡啶化间歇性区域，为降低MRD测定的频叛将获取了机才会。SEPT9，就是第一个利用毒素测定单等位基因吡啶化间歇性顺利进行筛查和晚期测定CRC的分析方法。尽管ctDNA吡啶化有这些优点，但这些相同的特性也所无需谨慎，以保持测定量化的选择性，并以求有假乙型肝炎的某种相对。

在这种背景下，Parikh和Taieb的这两项最新科学家在手果为我们对ctDNA效能的理解获取了有用的补充，即无无需原发其组织，大部分通过毒素ctDNA吡啶化或联合ctDNA等位基因型即可顺利进行吻合的MRD分析。与其他所无需对原发其组织顺利进行核酸以聘请后续ctDNA量化的测定多种不同，这两项科学家探究了Tumor-uninformed assays的正确性，它有几个占优势，以外短时间的TAT，降低初始开销，对其组织偏低或不应用于的较低血压顺利进行检测。

Parikh等人获取了一种ctDNA吡啶化在手合ctDNA基础等位基因型的互换panel顺利进行MRD的量化分析（NGS分析方法），与其他商业上可用的MRD测定分析方法比起，这种分析方法不所无需开刀的其组织以及独创化。在之后病症后转用时，这种大部分肝脏ctDNA-MRD测定对罹患带有病理意义的选择性（100%）和频叛将（55.6%），通过为基础表观真核生物相似性和纵向检测量化，其频叛将可进一步降低至91%。1 该分析方法被用于早就顺利进行的批判性科学家，以外聘请IIA期在手肠癌病症决策的NRG合作组科学家（NCT04068103）。虽然还所无需额外的信息集来正确性这些见到，但这些在手果断定了基于ctDNA的MRD测定在知悉的前提可遵从的测定效能相似性。

Taieb等人的科学家利用了一对在此之后被断定是CRC开刀后病状之外的吡啶化等位基因标示单单物WIF1和NPY（ddPCR分析方法），并将它们用到PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验车，将III期CRC较低血压随机分为3个同月 vs 6个同月的专用化学疗法。在对受邀III期试验车的III期CRC较低血压顺利进行的首次ctDNA-MRD分析之中面，有13.8%的较低血压术后为ctDNA-MRD乙型肝炎，并被确认为脱离的病状；也。3 同时，科学家者也指单单，与其他转用NGS分析方法的ctDNA-MRD科学家比起，本科学家之中面ctDNA的乙型肝炎叛将较低。频叛将和PPV某种相对略高于NGS测定在手果，ctDNA-MRD乙型肝炎和特征性的5年DFS分别为65%和73%，尽管专用病症的和不平庸的前量化在手果显示处理就才会对这些在手果显现出影响。该分析方法比如说的是其比起比较简单，极为低的开销和潜在的重现性，不所无需商业测定之中面所见的专利测定分析方法。早就顺利进行的批判性科学家将进一步分析大部分肝脏ctDNA测定是否能够吻合分析MRD，以便对CRC较低血压顺利进行不确定性分层，并聘请专用病症决策。

无论转用何种分析方法，大部分用肝脏ctDNA-MRD测定来聘请CRC较低血压的病症决定，所无需精确且吻合的测定分析方法。无需进一步降低大部分肝脏ctDNA-MRD测定的频叛将来具体哪些较低血压可以从病症榜尾之中面获益，以避免不恰当地选择较低危较低血压遵从较低强度的病症。Parikh及其朋友的科学家在手果表明，为基础真核生物和表观真核生物以及纵向肝脏检测，可显著降低大部分肝脏ctDNA-MRD的频叛将。比起之下，ctDNA-MRD测定的较低选择性对于ctDNA作为一个完整的生物；也来具体病症升级是至关极为重要的。由于选择性偏低，有假乙型肝炎的ctDNA-MRD就才会使较低血压遵从不必要的强化病症。Parikh及其朋友的科学家在手果断定，除基础等位基因型外，还可以通过在手合表观真核生物吡啶化相似性的量化来保持选择性。Taieb等人的量化分析方法的占优势在于降低了病理相似性的频叛将和病状，但是，正如科学家者承认的那样，单独的两个等位基因吡啶化标示单单有可能能够获取与在手合基础等位基因型分析方法的效能相似性。极为重要的是，这项工作也突显了基准化量化前条件的极为效用，因为各种提取分析方法可以在很大相对上影响ctDNA的得叛将和持续性。在将来的科学家之中面，这些量化前的回避将变得越发极为重要。

吡啶化被归属于MRD测定的潜质是完全一致的，愿意这些进展将之前降低更进一步MRD测定的效能。总之，大部分肝脏ctDNA-MRD的测定获取了一个独特的机才会，转用一种无创分析方法来探求病症方案，并有有可能根除较低危较低血压的微转移性软组织。这些科学家在手果无疑为将来ctDNA-MRD聘请的批判性病理试验车铺平了路段。

MRD，始终是一个短时间转型的信息技术开发，我们下半年近两年就才会单单现新的论据，要么显示单单MRD测定的病理功用的局限性，要么显示单单MRD测定的其他占优势和新功用。

简介：

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.